Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms