Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
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