Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC34Q96HJ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC34Q96HJ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms