Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPDL1Q96EA4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPDL1Q96EA4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms