Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF183Q96D59 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF183Q96D59 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF183Q96D59 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF183Q96D59 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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