Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-CQ95604 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HLA-CQ95604 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms