Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMARCC1Q92922 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMARCC1Q92922 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms