Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPBP1Q92547 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPBP1Q92547 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms