Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms