Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms