Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms