Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms