Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF554Q86TJ5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF554Q86TJ5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms