Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT28Q7Z3Y7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms