Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms