Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms