Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18B1Q6NT16 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms