Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATL3Q6DD88 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms