Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP188Q5SRE5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms