Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL22Q53GT1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms