Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT24Q2M2I5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT24Q2M2I5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms