Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRNQ16849 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPRNQ16849 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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