Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPP1Q16831 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPP1Q16831 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms