Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAMA3Q16787 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LAMA3Q16787 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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