Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NTRK2Q16620 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms