Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FXNQ16595 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FXNQ16595 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FXNQ16595 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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FXNQ16595 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FXNQ16595 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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