Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CNGA3Q16281 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CNGA3Q16281 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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CNGA3Q16281 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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