Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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VAMP3Q15836 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VAMP3Q15836 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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