Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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