Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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