Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NECTIN1Q15223 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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NECTIN1Q15223 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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