Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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