Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMC1AQ14683 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SMC1AQ14683 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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