Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCARB2Q14108 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCARB2Q14108 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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