Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDK13Q14004 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
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