Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PDE6HQ13956 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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