Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRSQ13332 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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PTPRSQ13332 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRSQ13332 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRSQ13332 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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