Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SKP2Q13309 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP2Q13309 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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