Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NME3Q13232 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME3Q13232 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME3Q13232 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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