Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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