Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM2Q13029 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
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