Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STX4Q12846 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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STX4Q12846 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STX4Q12846 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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