Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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