Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SREBF2Q12772 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms