Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD47Q08722 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD47Q08722 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CD47Q08722 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD47Q08722 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms