Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4DQ08499 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms