Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC3A1Q07837 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms