Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EGR3Q06889 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms