Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAV1Q03135 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms