Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPCQ01831 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPCQ01831 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms